食品科学与工程学院是按照塔里木大学发展的定位和要求而成立的新型工科学院。其前身可追溯至1994年的校直属食品科学教研室，先后历经农业工程学院、生命科学学院等单位，并于2021年9月正式成立食品科学与工程学院。学院成立以来先后荣获“第五批兵团民族团结进步示范区示范单位”，“兵团建功巾帼先进集体”，自治区和兵团“民族团结一家亲”和民族团结联谊活动“先进集体”，校级“文明单位”。
学院现有食品科学与工程校级优质建设学科（兵团重点建设培育学科）1个，拥有食品科学与工程一级硕士学位点和食品加工与安全农业硕士专业学位点各1个。有食品科学与工程、食品质量与安全、酿酒工程和食品卫生与营养学四个本科专业；在校本科生1169人，研究生90多人。食品科学与工程专业为省级一流本科专业。
学院现有教职工48人，其中专任教师36人（高级职称24人；具有博士学位教师15人），天山英才优秀工程师1人，兵团英才5人，天池英才1人，苹果岗位体系专家1人。柔性引进高层次人才4人，其中首席专家1人、特聘学者1人、讲座学者2人。
学院有教学科研办公面积8000M2,有条件优良的本科教学实验室、实习实训基地；教学科研仪器总值3000多万。有“南疆特色农产品深加工兵团重点实验室”等科研平台；有“中国农业科学院农产品加工研究所塔里木大学分中心”“浙江大学馥莉食品研究院南疆分院”等联合基地。学院与天润乳业、阿瓦提棉都慕萨莱思有限责任公司、新疆达尔生物科技有限公司、新疆图木舒克“绿糖心”冬枣种植专业合作社、新疆叶河源果业股份有限公司等20多家企业建成稳定的教学科研基地，开展了良好的产学研合作。
学院立足南疆、面向兵团、服务新疆，学科团队坚持按照“做塔里木文章、创区域性优势”的发展思路，长期围绕新疆特优林果、特色畜产品和新疆地区民族特色食品资源开展研究与开发工作。近五年承担各类项目60多项；获新疆维吾尔自治区科技进步奖二等奖、兵团科技进步奖三等奖多项；发表SCI、EI论文近百篇；获各项专利百余项；科研合作、服务基层、培训企业骨干500多人次，科技成果直接转化应用在南疆大地。
食品科学与工程学院把落实立德树人作为根本任务，弘扬兵团精神和胡杨精神，聚焦新型工业化，对接南疆产业发展需求，培养立足南疆、面向兵团、服务新疆的高素质专门人才和拔尖创新人才。学院将以党建促发展，提升管理水平、管理能力和效益，引领学院中心工作高效运行，按照学校“十四五”规划的指导思想，不断提升办学质量，推动学院事业高质量发展。
